急性甲沟炎多由葡萄球菌感染所致。这种细菌存在于人的皮肤上，一般情况下仅为污染，并不发生感染，这是因为人体具有局部和全身的防御功能。只有当机体防御功能降低，甲周皮肤完整性被破坏，或致病菌数量、毒力过大时，才会引起感染。慢性甲沟炎多由于经常受到潮湿、浸渍而造成绿脓杆菌、真菌(念珠菌、曲霉菌等)及普通变形杆菌等的感染。处理不及时则形成甲下脓肿，亦可发展成慢性甲沟炎及慢性指骨骨髓炎，出现慢性窦道，肉芽组织自窦口向外突出。