治疗幼年强直性脊柱炎的药物较多，但目前还没有能根治本病的特效药。常用的药物有以下两类：

　　（1）非激素类抗炎药：这类药物包括消炎痛（即吲哚美辛）、扶他林（即双氯芳酸钠）、布洛芬、萘普生等。具体方法如消炎痛25毫克，每日3次，饭后服，另外晚睡前在加用消炎痛栓剂50毫克，置入肛门内，这样可以较好地控制幼年强直性脊柱炎的外周关节炎及夜间和清晨的腰部疼痛、发僵和翻身困难。病情改善后，可以酌情减量。本类药物仅有抗炎与止痛作用，对幼年强直性脊柱炎的病情发展无控制作用。本类药物的效果虽基本类似，但作用机制有一定差别，个体差异亦较大，临床医生需根据病人服药后的反应，选择其中某一药物。

　　（2）改变病程药物：代表性药物为柳氦磺胺吡啶及甲氨蝶吟，此类药物有可能控制幼年强直性脊柱炎的病情进展。具体治疗方案，应在医生指导下进行。患者通常在服药2～3个月起效。本类药物没有止痛作用，所以需与非激素类抗炎药物合用。至于本类药物对已经发生骨质破坏的中晚期病变有无逆转作用，目前尚表示怀疑，所以主张应及早应用。